Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp11Q99K46 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp11Q99K46 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms