Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TrabdQ99JY4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TrabdQ99JY4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrabdQ99JY4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms