Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim11aQ99J19 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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