Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf112Q96DY5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf112Q96DY5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms