Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim59Q922Y2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim59Q922Y2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms