Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b3Q921M3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms