Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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