Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx18Q91ZR2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms