Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc5a4bQ91ZP4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc5a4bQ91ZP4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc5a4bQ91ZP4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms