Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atl3Q91YH5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms