Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trex1Q91XB0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trex1Q91XB0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trex1Q91XB0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms