Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chrna2Q91X60 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna2Q91X60 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms