Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Setd3Q91WC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Setd3Q91WC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Setd3Q91WC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Setd3Q91WC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd3Q91WC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Setd3Q91WC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms