Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms