Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhovQ8VDU1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhovQ8VDU1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms