Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms