Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf1Q8VDF2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1Q8VDF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1Q8VDF2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1Q8VDF2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf1Q8VDF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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