Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc28Q8VCE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms