Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SdsQ8VBT2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdsQ8VBT2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms