Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip5Q8R361 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms