Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Vmn1r200Q8R281 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Vmn1r200Q8R281 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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