Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Depp1Q8K2F3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Depp1Q8K2F3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms