Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Neil3Q8K203 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms