Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1H7

Tcp11l2, T-complex protein 11-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11l2Q8K1H7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcp11l2Q8K1H7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcp11l2Q8K1H7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms