Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1C9

Lrrc41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc41Q8K1C9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc41Q8K1C9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc41Q8K1C9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc41Q8K1C9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms