Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfm1Q8K0D5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gfm1Q8K0D5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms