Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Celf3Q8CIN6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms