Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf17Q8CFA7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf17Q8CFA7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms