Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm9955Q8CEJ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm9955Q8CEJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm9955Q8CEJ8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm9955Q8CEJ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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