Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9030612E09RikQ8CE20 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms