Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q8CDS7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8CDS7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CDS7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8CDS7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms