Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps53Q8CCB4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps53Q8CCB4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps53Q8CCB4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms