Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf4Q8CB96 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf4Q8CB96 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf4Q8CB96 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms