Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp20Q8C6M1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp20Q8C6M1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
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