Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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4933409G03RikQ8C5U0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933409G03RikQ8C5U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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4933409G03RikQ8C5U0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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4933409G03RikQ8C5U0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933409G03RikQ8C5U0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933409G03RikQ8C5U0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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