Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8C5C9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8C5C9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C5C9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8C5C9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms