Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf428Q8C1M2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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