Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim47Q8C0E3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim47Q8C0E3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms