Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc122Q8BVN0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc122Q8BVN0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc122Q8BVN0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms