Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scfd2Q8BTY8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scfd2Q8BTY8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scfd2Q8BTY8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scfd2Q8BTY8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scfd2Q8BTY8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scfd2Q8BTY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scfd2Q8BTY8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms