Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcgF3Q8BTQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PcgF3Q8BTQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms