Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Tcaf1Q8BNE1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tcaf1Q8BNE1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tcaf1Q8BNE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tcaf1Q8BNE1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tcaf1Q8BNE1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf1Q8BNE1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Tcaf1Q8BNE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf1Q8BNE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Tcaf1Q8BNE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf1Q8BNE1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Tcaf1Q8BNE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Tcaf1Q8BNE1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Tcaf1Q8BNE1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Tcaf1Q8BNE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf1Q8BNE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Tcaf1Q8BNE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf1Q8BNE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tcaf1Q8BNE1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tcaf1Q8BNE1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Tcaf1Q8BNE1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf1Q8BNE1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf1Q8BNE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf1Q8BNE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf1Q8BNE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf1Q8BNE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Tcaf1Q8BNE1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Tcaf1Q8BNE1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf1Q8BNE1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tcaf1Q8BNE1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tcaf1Q8BNE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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