Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnrc6bQ8BKI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms