Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prune1Q8BIW1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms