Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms