Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms