Protein–RNA interactions for Protein: Q80UZ0

Fgd5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd5Q80UZ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fgd5Q80UZ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgd5Q80UZ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms