Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Actr5Q80US4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actr5Q80US4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actr5Q80US4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms