Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec16aQ80U30 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clec16aQ80U30 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms