Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dsg1cQ7TSF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms